Проект Кей - это история о подростке Ясиро Исане, которого начинают преследовать два сильнейших клана, утверждая, что он убил их приятеля. Вместе с другом Куро Ятагами они начинают распутывать клубок событий и разбираться, где правда, а где ложь. В фильме также присутствует элемент фэнтези - любимая кошка Ясиро способна превращаться в человека. Вопросы, которые возникают у героев: могут ли они доверять Нэко, или же она на стороне предателей? Кто убил Татаро? И зачем началась охота именно на Ясиро?